潔凈空間檢測儀主要應用于：疾控中心、制藥行業、高校實驗、環境監測等場合，按照檢測方式可分為以下兩大類型的檢測。

一、微生物浮游菌檢測：浮游菌(英文名:airborne microbe)就是指懸浮在空氣中的活微生物粒子，微生物浮游菌采樣器是采集空氣中的微生物的儀器，一般用撞擊原理，儀器的吸氣裝置將空氣通過多孔采樣頭吸入，撞擊到培養皿上，空氣中的微生物即被“捕獲”到培養基上。經若干時間，在適宜的生長條件下讓其繁殖到可見的菌落進行計數，從而判定潔凈環境內單位體積空氣中的活微生物數，以此來評定潔凈室(區)的潔凈度。

二、塵埃粒子檢測：塵埃粒子計數器是用于測量潔凈環境中單位體積內塵埃粒子個數和粒徑分布的儀器。按照使用場合劃分可分為普通空間、潔凈空間兩種。按照測試通道按測試通道可分為單通道（只測某一種粒子徑）；雙通道（測試某兩種粒子徑）； 多通道（測試多種粒子徑）。

微生物浮游菌采樣器
從使用方式來分，主要分為手持式和臺式。手持式主要是FKC-1型微生物采樣器；臺式的主要為FKC-Ⅲ、FA系列、另外KW-1型空氣微生物濃縮采樣器是本公司研制的新型多功能采樣器，總氣路流(110～130) l/min，濃縮氣路流量7-12 l/min可調，其特點有：觸摸屏控制，屏幕可手動校準；

塵埃粒子計數器
手持式：
潔凈空間檢測的有Y09-3016，為六通道，HPC-300為三通道；HPC-600為六通道；采樣流量都是2.83L/min；
普通空間的塵埃粒子計數器主要是HPC-300A和HPC-600A兩個型號；
DT系列是多功能型的，為手持式。

臺式：
CLJ-E型是一款性價比比較高的臺式六通道的，流量是2.83L/min；
CLJ-F型六通道，有兩個采樣流量，采樣量2.83L/min及50mL/min，可用于器械管道中；
CLJ-3016型是六通道，采樣量2.83L/min，液晶屏顯示，鋰電池可工作6小時以上，有存儲報警功能，可連接電腦；
CLJ-310型28.3L大流量，六通道，主要用于制藥行業；
CLJ-530型六通道，采樣量50L/min，主要用于制藥行業。